Otra de las posibilidades para uso de estos desechos consiste en rellenar el área de Farfán para construir un segundo puerto en el área del Pacífico y una isla que sirva como área para almacenar contenedores o construir un depósito de petróleo.
El material que se sacó de la construcción del actual Canal se utilizó en la construcción de la calzada de Amador, que además de acceso a las islas Naos, Perico y Flamenco, ayuda como rompe olas para el normal funcionamiento del Canal en el lado pacífico.